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微生物及其代谢物为一项雄心勃勃的老龄化工程补充了燃料
发布时间: 2014-04-17     来源: www.technologyreview.com

    克雷格·文特尔的新公司想要通过创建世界上最大、最大全面的遗传和生理信息数据库来改善人类的寿命。

它为什么重要
更好地了解人体衰老能够有助于研究人员治疗多种疾病。
上周,基因组学的企业家克雷格·文特尔宣布了其最新的风险项目:一个将创建其所谓的在人体健康方面最全面、最完整的数据集来解决老年疾病的公司。
圣地亚哥的人类寿命公司表示,其将从每年对约40000人的基因组进行测序开始,使用Illumina的新型高通量测序仪(见“Illumina公司是否具有第一个价值1000美金的基因组?”)。最终,它计划努力达到每年高达100000的基因组。该公司还将对身体内部众多的杂菌居住体进行测序,这些杂菌居住体被称为微生物,该公司学将对在血液和其他患者样本中发现的成千上万的代谢物进行分析。
通过结合这些不同类型的数据,新的公司希望大举进入与其强烈相关的老龄化和许多疾病的神秘过程,这些疾病包括癌症和心脏疾病。“老龄化正在对人类施加一种力量,导致我们被暴露于疾病之下,并且疾病是千变万化的,部分原因是基于遗传,部分原因是由于环境,”在麻省理工学院研究老龄化并且没有参与该公司的伦纳德·瓜伦特表示。“我们许多研究老龄化的人的希望是通过拥有能够攻击老龄化主要途径的干预措施,我们能够影响疾病。”
但是,尽管几十年来都对老龄化及与年龄相关的疾病进行的研究,目前仍然没有能够延缓衰老以及延缓像癌症、心脏疾病以及老年痴呆症这样仍然困扰着患者的疾病的治疗方法。一个更全面的研究人口老龄化的方法能够有所帮助,瓜伦特表示。最关键的是通过观察基因活性以及在患者样本中发现的蛋白质和其他分子的数组变化来超越基因组测序。
因此,人类寿命公司将与Metabolon公司合作,该公司位于北卡罗来纳州的达勒姆,这两家公司将合作分析在研究参与者血液中循环的代谢产物。Metabolon公司在代谢组学领域是一个先驱,它记载了血液或其他样品中的氨基酸、脂肪和其他小分子,为疾病制定出了更为准确的诊断测试(见“2005年的十个新兴技术:代谢组学”)。
Metabolon公司使用质谱来确定样品中的小分子。在一个人类的血液样本中,大约有1200个不同的类型;Metabolon公司的进程也可以确定每种所存在的量。尽管基因组测序可以提供一些有关疾病遗传风险的信息以及一个人有可能将长春的一些提示信息,但是代谢数据可以提供关于什么样的环境、饮食和其他个人生活特征会影响健康的信息。
代谢数据还可以帮助研究人员解释以基因组为基础的研究的结果,其往往可以查明一个对疾病非常重要的特定基因或者是一个无法确认该基因实际做过些什么的正常细胞过程。如果在一个研究中,一个特定的代谢物被发现与一个特定的遗传信号相关,那么研究人员就可以根据DNA信号的功能来获得一个线索。
并且,血液中代谢产物的变化不仅仅是由人类细胞的行为造成的:在我们身体中的微生物产生了能够在血液中检测出来的代谢物,Metabolon的首席执行官兼创始人约翰·瑞尔斯表示。“当你得了某些疾病时,我们认为你的肠道微生物会改变它的成分,而这导致了令分子被制造出来的变化,”他表示。
瑞尔斯表示,他的公司与合作者的工作已经显示出了与老龄化相关的血生化改变:“你可以仅仅通过观察他们的代谢物就说出那些人有多大。”
人类寿命表示,其将向制药和生物技术公司以及学者授权其数据库中的信息。
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