达纳-法伯癌症研究所(Dana-Farber cancer Institute)儿科肿瘤学家杰西卡·蔡(Jessica Tsai)在分析儿童脑癌样本中的转录组序列时,惊讶地发现许多样本表达Forkhead Box R2(FOXR2),这是一种位于X染色体上的基因,通常只在睾丸中表达。
FOXR2是一个高度保守的转录因子大家族的一部分,在体内平衡和细胞稳定性中发挥作用。科学家确定FOXR2是许多癌症的致癌基因。然而,FOXR2诱导肿瘤形成的机制尚不清楚。
FOXR2通过多种机制在成人和儿童癌症中异常表达[1]
杰西卡·蔡与麻省理工学院博德研究所和哈佛大学的儿科神经学家普拉蒂·班多帕德哈伊(Pratiti Bandopadhayay)以及达纳-法伯癌症研究所领导的团队一起搜索癌症数据库,分析人类细胞培养物,并对动物模型中的肿瘤基因进行测序,以研究为什么FOXR2在如此多的癌症中表达增加。
在筛选了10000例成人和儿童癌症样本后,该团队发现FOXR2在70%以上的所有癌症类型中异常表达,包括成人黑色素瘤、非小细胞肺癌、儿童神经母细胞瘤和脑瘤。
研究人员还发现,几乎80%表达FOXR2的肿瘤在DNA的一个新区域FOXR2外显子-3启动转录。他们发现FOXR2 Exon-3启动子是癌症细胞中FOXR2表达所必需的,FOXR2基因周围X染色体区域的低甲基化激活了该启动子。
该团队接下来研究了FOXR2转录因子针对癌症样本中的哪些基因,他们发现FOXR2与通常与E26转化特异性(ETS)转录因子(ETS TF)相关的DNA序列结合,后者控制具有多种细胞功能的基因的表达。
辛辛那提大学药学研究员、该研究的合作者蒂莫西·菲尼克斯(Timothy Phoenix)表示:“FOXR2和ETS TF可以与DNA相互作用,并实际开启和关闭基因,从而导致癌症。”。
开发抑制FOXR2表达的癌症治疗方法是癌症研究人员感兴趣的,因为它通常不在健康细胞中表达。虽然健康的睾丸细胞确实表达FOXR2,但有一种独特的屏障系统,称为血睾丸屏障,可以排除潜在的FOXR2靶向治疗。
尽管研究人员对FOXR2在癌症中的作用有了更好的了解,但他们仍然不清楚它是如何发挥作用的。蒂莫西·菲尼克斯和他的团队希望识别FOXR2与之相互作用的特定蛋白,这将使他们能够识别潜在的治疗靶点。
参考文献:
[1] Tsai, J.W. et al. FOXR2 is an epigenetically regulated pan-cancer oncogene that activates ETS transcriptional circuits. Cancer Res 82, 2980–3001 (2022).
[2] Liu, A.P.Y. and Northcott, P.A. Pursuing FOXR2-driven oncogenesis. Cancer Res 82, 2977–2979 (2022).
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