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全球首发,AI模型双重预测分子蛋白复合物结构;英矽智能、达歌生物等获融资 | 6月AI小分子新闻月报
发布时间: 2022-06-29     来源: 药明康德

AI在药物研发领域的应用正以星火燎原之势迅速发展,而小分子药物开发则是与AI技术交融最深的药物研发细分领域之一,下面创鉴汇整理了6月AI技术应用于小分子药物研发的行业资讯,以供读者参考。

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# 热点速递 #
全球首发!星药科技TBind深度学习模型开启分子蛋白复合物结构预测新纪元

近日,星药科技预发表了Trigonometry Aware Neural NetworK for Drug-Protein Binding Structure Prediction。据悉该模型是全球首个能同时预测小分子和靶蛋白三维结合构象和结合亲和力的深度表征学习框架,大幅超越现存方法的最好结果。TBind采用端到端的数据驱动范式,结合物理启发式的几何图神经网络,打通了复合物三维结合模式及结合强度的双重预测,实现了对国际商业分子对接软件精度和效率的双超越,为分子蛋白相互作用预测提供了中国首个突破性方案。继AlphaFold之后,将计算驱动的药物研发带入新的纪元。

英矽智能(Insilico Medicine)是一家临床阶段的端到端人工智能(AI)驱动的药物发现公司,今天宣布已完成6000万美元D轮融资。本轮融资将进一步加强该公司财务状况,并推动其推进管道的增长,包括目前处于1期研究的领先项目,以及其Pharma.AI平台的持续开发。所得款项还将资助正在进行的全球扩张和计划中的战略计划,包括全自动、人工智能驱动的机器人药物发现实验室和完全机器人生物数据工厂,以补充英矽智能庞大的精选数据资产。英矽智能正在使用下一代人工智能系统将生物学、化学和临床试验分析联系起来。该公司开发了人工智能平台,利用深度生成模型、强化学习、变压器和其他现代机器学习技术来发现新目标并设计具有所需特性的新分子结构。英矽智能正在提供突破性的解决方案,以发现和开发治疗癌症、纤维化、免疫、中枢神经系统疾病和衰老相关疾病的创新药物。

02
# 研发进展 #
星药科技利用AI发现针对自身免疫性疾病的小分子临床前候选化合物


星药科技利用自主研发的的人工智能药物发现平台Pyxir确定了一种新型的治疗自身免疫性疾病的临床前候选化合物(PCC)。该临床前化合物由AI生成、筛选并参与迭代,不仅具有全新的骨架结构和独立的IP空间,在药效、药代动力学、安全性等方面表现优异,且在体外和体内临床前研究中都显示出颇有前景的结果。此次临床前候选化合物的成功发现,验证了星药科技以AI为核心,技术驱动药物发现能力的闭环。

03
# 融资动态#
达歌生物完成2200万美元A轮融资,结合AI等筛选技术加速分子胶药物开发


2022年6月9日,达歌生物 (Degron Therapeutics) 宣布已完成2200万美元的A轮融资,本轮融资由幂方健康基金领投,德屹资本、百度风投和芯航资本跟投,种子轮股东凯风创投和元生创投继续加持。A轮融资将用于推进该公司的GlueXplorer平台。GlueXplorer是一个独特的基于分子胶水的靶向蛋白降解平台,用于加速开发针对肿瘤、炎症、代谢性疾病、罕见疾病和其他治疗领域中以前无法治愈的靶点的新型药物。该公司现已有三个管线项目进入了先导化合物优化阶段,其中包括一个潜在“first-in-class",在多种肿瘤和免疫疾病中有重要作用的靶点。
达歌生物于2021年4月在上海投入运营,是一家具有独特的分子胶(Molecular Glue)靶向蛋白降解技术平台的新药研发公司。使用其专有的GlueXplorer平台,达歌生物创建了一个独特且不断扩展的分子胶化合物库,可以靶向以前无法成药的靶点。达歌生物的平台结合表型筛选、蛋白质组筛选和人工智能来预测新靶点并加速化合物发现。
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默达生物完成上亿元种子轮及Pre-A轮融资,加速三款AI赋能的小分子靶向创新药临床开发

近日,中国首家基于免疫代谢靶点的小分子创新药研发公司深圳默达生物科技有限公司(META Pharmaceuticals)宣布连续完成共计上亿元的种子轮和Pre-A轮融资,领投方包括Forcefield Ventures、晶泰科技、IMO Ventures、天图资本。默达生物基于免疫代谢领域的前沿科研进展,打造AI(人工智能)赋能的代谢通路药物靶点发现平台,并与AI药物研发公司晶泰科技强强联手,以新生物机制、新解法,针对免疫和代谢系统紊乱造成的各种慢性疾病研发潜在“first-in-class”药物,为患者带来新一代更加安全、高效的自身免疫疾病药物。

此次融资将用于加速默达生物在研的三个小分子靶向创新药向临床试验推进,并进一步拓展其AI代谢酶靶点发现平台的开发,在更多不同适应症上完成预测和验证。
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CHARM Therapeutics完成5000万美元A轮融资,利用DragonFold AI技术改变基于结构的药物发现

CHARM Therapeutics是一家3D深度学习研究公司,近日宣布完成了由F-Prime Capital和OrbiMed共同领投的5000万美元A轮融资。CHARM Therapeutics正在开创端到端的3D深度学习,以发现和开发针对以前难以药物靶点的转化药物。该公司的专有平台DragonFold运用蛋白质-配体共折叠方面的专业知识,提供针对癌症和其他疾病领域具有挑战性的分子靶点的转化药物。CHARM Therapeutics的专有DragonFold技术由David Baker和Laksh Aithani开发,使用端到端3D深度学习来预测基于蛋白质一级序列和配体化学结构的蛋白质-配体复合物的共晶结构。该公司正在构建一个强大的引擎,将这些3D预测转化为新的小分子疗法,这些疗法可以调节最初在癌症中具有挑战性的目标,并有可能改变患者的生活。

Anagenex完成3000万美元A轮融资,凭借新型ML定向进化平台赋能小分子药物发现

将大规模数据生成与机器学习相结合以发现下一代小分子药物的领先药物发现公司Anagenex宣布近日已完成3000万美元的A轮融资。Anagenex平台以迭代方式并行评估多达数十亿种化合物,以生成非常高质量的数据。首先,Anagenex使用DNA编码文库(DEL)和亲和选择质谱等多种技术对数十亿种化合物进行平行实验测试。这些测量值输入专有机器学习(ML)算法,该算法不仅考虑该实验的结果,还考虑来自内部数据库的数千亿个其他数据点。然后,经过训练的ML模型设计下一代“进化”的化合物进行测试,Anagenex然后对其进行合成和测试。这创造了一个真实数据完善ML模型的良性循环,进而在每个循环中驱动更好的数据。
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# 交易概览 #
PharmEnable宣布利用AI药物发现平台与Denali Therapeutics在神经退行性疾病领域开展多靶标合作

AI药物发现公司PharmEnable近日宣布与生物医药公司Denali Therapeutics合作,开发了广泛的产品组合候选物,这些候选物被设计用于跨越血脑屏障(BBB)治疗神经退行性疾病。在这次合作中,PharmEnable将利用其专有的AI药物发现平台与Denali在跨BBB和神经退行性病变递送方面的专业知识,针对具有挑战性的靶标鉴定治疗相关性的小分子化学物质。战略合作的目标是加速神经退行性疾病的药物发现,在多年计划中解决未公开的靶标。Denali将负责这些分子的进一步先导物优化、开发和商业化。根据协议条款,PharmEnable将获得现金预付款,并将有资格获得开发和商业里程碑付款。

Excelra与HotSpot Therapeutics合作,数据+ML/AI模型加强变构药物发现

全球领先的数据和数字洞察组织Excelra宣布与HotSpot Therapeutics建立合作伙伴关系,HotSpot Therapeutics是一家率先发现和开发小分子变构疗法用于治疗癌症和自身免疫性疾病的生物技术公司。HotSpot Therapeutics计划将Excelra的旗舰产品GOSTAR的数据部署到选定的蛋白质靶点,以增强其变构抑制剂候选管线。该合作伙伴关系旨在通过将GOSTAR的高质量注释数据集整合到HotSpot的机器学习(ML)和人工智能(AI)模型中来加强HotSpot的药物发现和开发工作。随着GOSTAR数据的整合,HotSpot将继续推进小分子治疗候选药物的发现和开发,这些候选药物针对的是传统小分子方法难以药物或无法药物治疗的变构靶点。

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