来源:科罗拉多大学安舒兹分校医学院

简介:

最近的一个案例研究对许多基因的改变进行了测试，结果发表了第一个发表的报告，描述了在肺癌患者中成功地瞄准了MET融合。

有很多方法可以改变基因，并且有许多基因在改变后会引起癌症。每一种癌症相关基因的每一种可能的改变都是单独测试的，这是不可能的，因为它需要数百个单独的测试和成千上万的美元。今天，在JCO精密肿瘤学杂志上发表的一篇科罗拉多大学癌症研究中心的案例研究突出了另一种选择:利用可以同时在许多基因中寻找基因改变的测试。这项技术成果发表在第一个发表的报告中，描述了在肺癌患者中成功地实现了MET融合。

在这项研究中，研究人员使用一种检测数十种基因的基因融合的方法，对晚期肺癌患者的肿瘤样本进行了检测。这项测试发现了一种罕见的融合基因，使研究人员用靶向治疗crizotinib来治疗癌症，这种疗法抑制了会面信号(包括其他类型的信号)。在靶向治疗开始8个多月后，被诊断为第四阶段肺癌的患者继续表现出几乎完全的反应。

“我们对第四阶段肺癌患者进行治疗和治疗的方法包括广泛的分子分析，这就是我们所做的，”病人的肿瘤学家、肿瘤中心的临床和转化研究的高级研究员，肿瘤中心和CU医学院的临床和转化研究的高级研究员特里吴说。

测试中用于此分子分析是一个相对较新的试验称为阿切尔FusionPlex ArcherDX为基础开发的生物技术公司,为临床测试和验证由科罗拉多分子相关实验室(CMOCO),一个先进的分子诊断实验室这是科罗拉多大学病理学系的。该测试没有测试单个基因的改变——例如，对已知的致癌基因ALK、ROS1或EGFR进行单独的测试，而是探索了一整套的基因变化，同时测试了53个与癌症相关的基因中的“基因融合”。

在这些基因融合中，一个基因的片段偶然地与另一个基因相连。这就产生了“嵌合蛋白”——一种由各部分组成的新蛋白质，可以促进癌症的生长。在肺癌中有两个很好的例子是融合了基因ALK和ROS1的融合。这一基因相遇也被认为是引起癌症的融合的一个伙伴，事实上，对MET基因的其他改变包括MET的突变，MET的放大，以及被称为“14-14跳跃”的突变已经成为肺癌临床试验中研究药物的目标。然而，对MET融合的测试并不常见。

“在肺癌中，MET融合的频率非常低，远低于1%。”你永远不会单独测试它们。你需要一种能同时观察许多事情的分析，以捕捉这些罕见的事件，”Kurtis Davies博士说，他是领导分析开发科学家CMOCO。

更让人质疑的是，识别一种满足融合基因的基因不仅需要测试，而且要以一种非常具体的方式进行测试。

“很多测试都说他们覆盖了会面，但这并不意味着他们会接受这种特殊的改变。”根据你的顺序和你的顺序，你可能会或可能不会发现这一改变，”Robert C.Doebele说，他是医学博士，医学中心的研究人员，同时也是医学院的医学肿瘤学副教授。

2016年，这位来自外州的病人打算在丹佛花三个月的时间来看望女儿。她之前被诊断出患有肺癌，并且知道在科罗拉多州她需要来自当地的治疗团队。

当她来到科罗拉多大学医院时，“我们可以看到她的肿瘤在生长，”吴说。

库癌症中心的研究小组要求在早期手术中移除患者肿瘤样本，并使用该样本进行分子检测。

“在CU上，除了大多数社区中心所使用的测试，寻找EGFR、l1、ALK和ROS1这样的测试，我们还做了一个更广泛的小组。我们寻找KRAS，见过放大，见过14次跳过突变，特雷基因重组，brafv600突变，HER2突变等等。所有这些都是负的。但是我们要做的另一件事是基于rn基的下一代测序分析，叫做FusionPlex。这个NGS平台在53个与癌症相关的基因中寻找基因融合。这个实验的独特之处在于，你不需要知道一个基因的融合伙伴来识别基因融合，”Ng说。

这就是研究小组如何确定病人的会面融合的方法。下一步是决定如何治疗它。

“很多人不知道药物crizotinib最初被设计为一种抑制剂的基因产物,”戴维斯说,他指出,该药物的第一个FDA的批准是不反对了但对ALK-positive肺癌和最近批准治疗ROS1-positive肺癌。“但现实是，这门课的大多数药物都达到了许多目标。有时这是有害的——它会打击你不想触及的东西。这是一个例子，它是有益的。”

在目前的病人中，这种以crizotinib为目标的策略显示出了引人注目的结果。

“她的第一次扫描显示出几乎完全的反应，完全没有肺结节，”吴说。副作用包括增加的疲劳，“但是总的来说没有任何威胁生命的东西，或者阻止她继续服用药物，”吴恩说。

根据Doebele的说法，这项研究的结论是双重的。首先，“这项研究表明了广泛的分子检测的重要性，同时也表明了商业实验室对其所覆盖的内容的透明度的重要性，”他说。第二，“这个病例报告和另一个描述了在gliobastoma中使用crizotinib的案例表明这是一种合理的非fda批准的治疗这些患者的方法。然而，该方法需要在临床试验中进行研究，我们希望这一案例表明，符合易位的临床试验应包括在药物评估抑制剂疗效的试验中。”

至于病人，吴恩说:“那天她来探望我们，她告诉我她很幸运能到科罗拉多州来看望我们。”否则，她永远不会在癌症中发现这一致命弱点。”