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新标准有助于确保HER2乳腺癌基因的准确临床测量
发布时间: 2016-09-14     来源: 国家标准和技术研究所(NIST)

HER2参考材料是NIST研制的测量工具中最新增加的工具,帮助推进基因组学式的精准药物

资料来源:

国家标准和技术研究所(NIST)

摘要:

研究展示了新的测量参考资料在为临床应用评估检测性能以及增加有关HER2扩大信心的报告方面的价值。

国家标准与技术研究所开发的新的测量标准得到了弗雷德里克国家癌症研究实验室地成功使用,检查新一代DNA测序技术的性能,用于评估与乳腺癌患病风险增加相关的基因变异。

弗雷德里克国家实验室是由国家癌症研究所主办的,其分子表征实验室(MCL)的科学家们评估了NIST HER2标准参考物质(SRM 2373)在确保HER2基因复制数量测量精度方面的有用性。HER2基因的过度复制表明具有较高的激进形式乳腺癌的患病风险。

进行的试验在评估检测性能以及增加有关HER2扩大信心的报告方面“清楚地表明了SRM 2373 的价值”,弗雷德里克国家实验室和NIST的研究人员在新一期的《分子诊断》杂志中报告称。

“该基因是治疗选项的一个生物标记物。像HER2检测这样的诊断型序列测试令我们能够根据肿瘤的基因构成为个别患者选择最佳的治疗方案,”MCL的主管米奇·威廉姆斯称。

正常细胞具有两个HER2的复制体,但是20-25%的乳腺癌患者具有该基因多个复制体,导致HER2-编码的蛋白质生产过剩。该基因的扩增刺激肿瘤在这类乳腺癌患者体内生长得特别迅速——美国大约每年有4万名妇女患上此类乳腺癌。

幸运的是,这些患者可以用称为曲妥单抗(商品名赫赛汀)的单克隆抗体来进行治疗,针对并且抑制具有高于正常水平的HER2蛋白质的肿瘤细胞的生长。据发现,较传统的化疗药物与曲妥珠单抗的组合能够显著增加长期生存率。

该治疗方案可能具有不良的副作用,因此筛查能够通过测试获得最佳收益的患者是非常重要的。然而,过去使用的两种正在向基因组筛查过渡的主要测试——一种依靠荧光探针,而另一种依靠组织染色——很容易出错。大约20%的测试有可能产生不准确的结果,无论是假阳性还是假阴性都有可能 。

事实上,NIST原本着手开发测量工具,用于改善这些诊断测试的准确性。但是由于新一代基因组测序的迅速崛起,NIST选择把重点放在开发测量参考资料上,支持新技术更敏感并且更具体的检测能力。

SRM 2373是由五个乳腺癌细胞系中提取的DNA构成的,每个都具有不同的HER2基因平均复制数量,相对而言有一组选定的不变参考基因。在五瓶一组的设置中,NIST认证的HER2复制体与参考基因组的比率正好从一至十八。

“与弗雷德里克国家实验室的合作对于NIST是非常有价值的,确保我们开发的参考材料是有意义的,并且在迅速变化的癌症分子诊断领域满足了临床及研究组织的需求,”NIST的生物化学家肯尼思·科尔表示。

这个HER2参考材料是NIST开发的用于帮助促进基因组学式精密药物的测量工具不断增加的列表中最新的添加物。NIST还将继续与弗雷德里克国家实验室的研究人员和业界进行合作,提高有些称为液体活检的无细胞循环肿瘤DNA的检测及可靠计量。循环肿瘤DNA在许多癌症中都得到了检测,并且可能被用于监测患者的治疗进展,以及肿瘤是否发生异变对治疗方案产生抗性。

NIST最近与SeraCare生命科学签署了一份为期三年的合作研究与开发协议,就一个对该公司的循环肿瘤DNA参考材料的测量方法进行比较的多实验室研究进行合作。

在2015年,NIST与其Genome in a Bottle联盟中的合作伙伴为全基因组变体评估发布了NIST参考资料(RM)8398人类DNA,其中人们对表征的大约77%的基因组都具有较高的信心。美国食品和药品监督管理局利用基因组参考材料作为其刚刚完成的精密FDA一致性挑战的“真集”,意在推进整个人类基因组测序的质量标准。

在2016年5月,NIST发布了“蛋白质组学的多肽混合物”(RM8321),其中包含440个合成肽,或蛋白质片段。蛋白质组学是对蛋白质的鉴定及研究,通过基因进行编码,并且最终成为身体内的“实干家”,单独或以组织进行行动,推动健康与疾病所涉及的程序。

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