染性疾病常常让我们浑身不自在，近日，刊登在国际杂志PLoS ONE上的一篇研究论文中，来自布莱根妇女医院的研究人员利用特殊的计算机模型揭示了机体感染影响肠道天然菌群的分子机制，相关研究或可帮助临床医生们开发治疗胃肠道感染及炎症的新型疗法。

    研究者Lynn Bry表示，我们肠道中的细菌数量是机体细胞的10倍以上，而面临感染时，这些复杂菌群的生态系统的表现会大大影响我们机体的健康。文章中研究者开发了一种新型计算机算法，它可以对柠檬酸杆菌引发的感染的不同阶段进行分析，柠檬酸杆菌可以引发小鼠患病，类似于人类食物中毒的表现。
研究者将柠檬酸杆菌引入小鼠肠道中，两个月后就可以在小鼠肠道中的多个位点发现不同水平的柠檬酸杆菌，这种新型计算机算法可以帮助研究人员在和感染、炎症相关的肠道复杂菌群中鉴别出细菌的动力学改变。
    采用一种传染性结肠炎小鼠模型与病原体枸橼酸rodentium，研究者们2个月的时间产生了序列16S rDNA基因谱，并定量培养的共生，在感染和未感染的小鼠小肠多站点。研究者发现个别类群的时变特征的计算框架，并自动签名鉴定微生物的子社区内较大的肠道生态系统，证明了普通的行为。
    当小鼠处于感染期间时，研究者在小鼠肠道的不同位置发现了正常菌群的许多破坏情况，比如，研究人员发现小鼠结肠组织中的细菌标记在小鼠感染细菌后出现症状之前的水平不断下降，而其它的标记包括梭菌和乳杆菌家族的水平出现了上升的趋势；更有意思的是，这些标记中的一部分会在肠道感染病原体的位点中发生，其并不会直接损伤宿主的细胞。
    研究者Bry表示，从临床角度来讲，我们鉴别出的这些新型微生物标记可以帮助临床医生们检测机体的早期炎症或者胃肠道疾病患者持久耐药性疾病，比如炎性肠病；而研究者鉴别出的许多时间依赖性的微生物标记或许可以帮助科学家们开发出治疗感染和炎性疾病的新型靶向疗法。