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刷屏世界的“超级变种”Omicron刺突蛋白图像公布!突变氨基酸残基数是德尔塔2.4倍
发布时间: 2021-11-29     来源: 医谷

11月27日,意大利罗马耶稣儿童医院的多模式医学实验室公布了全球首张关于新冠病毒变异毒株Omicron(奥密克戎)的图片。图片显示,Omicron毒株拥有更多的刺突蛋白突变。


德尔塔毒株与奥密克戎毒株刺突蛋白突变对比图,变化最大的区域用红色标记(图片来自罗马儿童医院)

在德尔塔变异毒株中突变的氨基酸残基数量为18个,而在新毒株奥密克戎中则有43个。这些变异多样化,且大部分位于与人体细胞相互作用的区域。研究人员表示,这并不一定意味着奥密克戎更危险,而是意味着病毒为了更加适应人类物种,产生了另一种突变。进一步的研究将告诉我们这种适应是中性的不那么危险的,还是更危险的。

“超级突变株”Omicron

Omicron 最先在非洲南部的博茨瓦纳被发现,随后在南非的豪登省迅速传播。11 月24日,世卫组织首次收到南非对于该突变株的报告,11月26日世卫组织将该突变株列入关注清单,命名为Omicron。这是所有突变株中,世卫组织响应最为迅速的一次。

世卫组织的声明指出,这一变种出现的时间与南非近日新冠病例迅速增加的时间重合。初步证据显示,与其它变种相比,Omicron可能让人群被新冠病毒再次感染的风险升高。目前南非几乎所有省份都已发现这一变异株,并且病例数量都在快速增加,同时变异株更有可能具有竞争优势。


在 Delta突变株过后,南非近来疫情走势比较平缓,但 Omicron 出现以来,感染者曲线再次出现上升趋势。图片来源:金融时报

根据英国卫生安全局的说法,Omicron的刺突蛋白与新冠疫苗所基于的原始新冠病毒毒株的完全不同。同时Omicron携带着大量的基因突变,仅在刺突蛋白上就有30多个突变,包括了在关键部位ACE2受体RBD区域的10个突变。相比之下,Delta 突变株在同一区域只有 2 个。

刺突蛋白是“病毒用来打开人体细胞大门的钥匙”,出现众多突变的新冠病毒变体可能会绕开人体的免疫系统。南非教授理查德·莱斯赛尔表示,“研究结果让我们担心,这种变异病毒可能更具传染性,增强了人际传播的能力,还能绕过部分免疫系统”。同时,与已经传播的其他变异病毒“非常不同”,意味着基于原始毒株设计的疫苗可能没那么有效。

不过,世卫组织表示目前对这一新型变异毒株还所知甚少,评估它是否更具有传染力或对疫苗更具有抗药性,仍需要更多实验数据。

香港确认3例感染病例

11月27日,香港确认3例感染病例,均为输入病例,包括1名男性和2名女性,年龄在47岁至72岁之间,分别来自英国、印度及俄罗斯,来自俄罗斯的确诊病例为机组人员。确诊病例中,有2人抵港时在机场临时样本采集中心的检测结果呈阳性,剩下1人于隔离检疫期间确诊。

截止目前,比利时、英国、德国、意大利和捷克共和国均已确认感染奥密克戎的病例;荷兰从南非飞抵的两趟航班中85人核酸检测呈阳性,荷兰卫生部称有95%的把握确认其中61人感染了Omicron;而以色列在发现2例疑似Omicron感染者后已宣布关闭边境,禁止所有外国旅客入境,成为全球首个因Omicron毒株而封锁国境的国家。

新冠口服药和新冠疫苗对Omicron效果如何

根据MedTrend医趋势的报道,基于默沙东、辉瑞新冠口服药的设计原理,两种药物具有不同的作用靶点,可能会对Omicron变体感染者有不同的治疗效果。

默沙东方面,Molnupiravir的作用机制为靶向新冠病毒用于自我繁殖的酶,在其遗传密码中插入错误编码,从而减慢其传播和侵占人类细胞的能力。此前基于Molnupiravir的两项独立临床试验和体外研究都证实,病毒刺突蛋白的突变并不影响Molnupiravir的活性,因此只要Omicron变体中尚存Molnupiravir插入编码的靶点,其有效性将能够维持。

辉瑞方面,Paxlovid属于蛋白酶抑制剂类,作用靶点是是3CLPro,Paxlovid可通过阻断3CLPro抑制病毒繁殖。此前的体外实验证实其能够强力抑制SARS-CoV-1的3CL蛋白酶活性,而SARS病毒和新冠病毒的3CL蛋白酶在与底物结合的位点上具有100%的序列同源性,这意味着它也很可能对新冠病毒的3CL蛋白酶具有强力的抑制效果。目前看来,Omicron 3CLPro发生变异的概率似乎也不大。

两种药物不同之处在于,Paxlovid直接抑制了新冠病毒RNA聚合酶的作用,阻断了病毒复制过程;而Molnupiravir并没有阻断RNA的复制,而是通过给病毒“假”的核苷类似物,来替代C和G碱基,从而生成突变的遗传物质。

相比于新冠口服药,疫苗类产品则更易受病毒刺突蛋白变异的影响,不过目前Moderna、BioNTech、Inovio、科兴生物等疫苗企业也开始了一系列行动,加速新冠疫苗对Omicron的有效性验证。
文 | 医谷
 

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