【新闻事件】:今天 J. Med. Chem. 发表一篇原福泰 CSO、著名计算化学家 Mark Murcko 的一篇文章,他根据他个人经验总结了成为优秀药物化学家的 28 条素质。其中包括科学家通用的素质如持之以恒、满腔热情、尊重数据等,也包括药物化学特有的素质如心中永远装着目标化合物应有特征、不畏惧高难度合成、高度重视生物学等。他自己说这些建议并非新颖创意,更多是过来人对新入行年轻人的经验之谈。有些人可能觉得这些建议听起来像是老人的喋喋不休,但要真正理解他说的这些还真需要一些实践经验。
【药源解析】:所有学科通用的素质就不说了,你要是觉得你的自信可以代替数据还是干点别的吧。今天重点说说作者提到药化特有的几个素质。目标化合物需要特征(TPP)一般项目开始前需要整个团队讨论决定,优化全面性质而不仅是活性现在也基本是常识、会体现在 TPP 里。三维想象力对于化学家不是困难的事情,如果构象分析还没整明白那么药物设计确实有点难度。新分子骨架确实非常重要,即使药物成功进入临床一般大公司也会找一个不同骨架的候补药物。遇到确证靶点不要轻易放弃十分重要,没有任何新药不曾经历过严重挫折。当然确证靶点是个事后诸葛亮概念,动物确证的靶点意义有限。另外坚持不懈也要有度的掌握,做粉状蛋白的估计已经有人后悔了。同样 IP 也不是永远都能摆平,问问百健和赛诺菲可能会听到不同看法。新手可能觉得做化学的只要设计合成化合物即可,但深入了解靶点生物过程十分重要,现在不理解以后慢慢体会。不畏惧高难度化合物是个正在失去的素质,现在合成高手现在越来越少、这对深挖化学空间是个不利因素。
他提到的最后两点都和经验有关,经验确实是药物化学的重要成分。知道成功、失败项目在历史转折点曾经做出的选择对你解决将要遇到的难题很有帮助,因为药化问题通常不能仅靠科学原理解决。这类似法律界的司法先例原则。尽管法律有明确规定,但遇到具体问题还需要有过去案例作为标杆。新药发现的条文多一半写的含糊不清、做出正确决定所需要的信息几乎永远都不完整,遇到问题就更依赖过去在相似情况下的经验。现在发现药物压力巨大,即使有过沉痛教训的老江湖还经常觉得 this time is different,涉世不深的年轻人就更难以把握复杂的局势判断。
药物化学是个复杂的学科,并不是说药物化学晦涩难懂,而是药物化学还没有形成一门可以自圆其说的学科。这是一个科学、艺术、手艺的混合体,没有人能不经过长期实践就能成为优秀药物化学家。据原默沙东研发总监 Bill Greenlee 估计一个优秀的博士毕业生需要 15 年的磨练才能成为技术比较全面的药物化学家。因为药物化学并非严格科学,所以这些成熟化学家面对同一问题会给出完全不同的解决办法。原 Pharmacia 曾做过实验让多名经验老道药物化学家从一堆化合物挑选自己认为看上去最好的化合物,意见分歧如同 Yanny 和 Laurel。
Murcko 是福泰的缔造者之一,在药物化学界名气不小。他发明的分子相似程度指数和对分子骨架、修饰方式的分析有较大影响。文章有些观点相互重叠,如了解老药发明历史和知识再利用都是经验的一部分,牢记 TPP 和知道下一步做什么化合物也是一个意思。他说有这些素质的人远远比其他人更可能发现新药、鼓励这种企业文化的公司也可能更成功。这个结论基本是个人经验,不大可能有真正数据支持,所以有点与他所说的尊重数据不太相符。另外运气这个最重要因素也没有提及,如何把握瞬间即逝的机会也是一个重要技能。不过瑕不掩瑜,他的这些经验之谈还是值得年轻人借鉴的。
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