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流感预测工具利用进化来进行早期预测
发布时间: 2018-01-16     来源: 麦肯息讯

预测季节性流感暴发的新模型通过考虑与近年来的病毒变化相比,做出了更好的预测。

来源:

芝加哥大学医学中心

概要:

一种新的流感预测工具旨在通过将病毒传播的数据与最近几年的病毒进化程度的估计结合起来,从而做出更好的预测。从2002年到2016年,这个新模型准确地预测了美国每一季的病例总数,并对2016-2017赛季的预测做出了准确、实时的预测。

每年,公共卫生官员都在监测流感的传播,以确定哪些流感病毒需要进入当年的疫苗,以及疫情将在哪里爆发。但是很难预测一个特定的流感季节会有多糟糕,直到人们真正开始生病。

芝加哥大学的科学家们建立了一种新的流感预测工具,旨在通过将病毒传播的数据与最近几年的病毒进化程度的估计结合起来,从而做出更好的预测。利用历史数据作为一项测试,新模型准确地预测了从2002年到2016年美国每一季的病例总数,并对2016-2017赛季开始前的2016-17赛季进行了准确、实时的预测。

研究人员说,本周在科学转化医学上描述的新模型可以用来补充现有的预测工具,通过在季节开始前提供预警,从而实时追踪流感的爆发。

“将病毒进化的信息与流行病学数据相结合,将在季节开始之前产生疾病预测,比目前的情况要早得多,”Mercedes Pascual博士说,他是u芝加哥的生态学和进化教授,也是这项研究的资深作者。“你可以想象,利用我们的模型对整个季节的整体严重性做出早期预测,然后用其他方法预测疫情爆发的时间。”

每年,四种流感病毒株在人类人群中传播:H3N2,H1N1,和两种B变种。由于一种被称为抗原漂移的现象,这些病毒每年都有季节性的传播。它们的进化足以避开人类的免疫系统,但不足以发展成全新的病毒变种。

如果病毒发生了很大的变化,更多的人会生病,因为他们没有接触到这种特殊的变异。但是大多数流感预测模型并没有考虑到这种变化。相反,它们是建立在对病毒传播速度的数学计算基础上的——这些预测在当前的季节已经开始之前是不可能的。

对于这个新模型,Pascual和Pascual博士,在芝加哥大学的博士后研究人员,分析了之前的H3N2病毒的基因序列。然后,他们将这些样本与在每年季节开始前收集的当前病毒的早期样本进行比较。这使得他们能够为当前的病毒创建一个进化指数,或者衡量它发生了多大的变化。将这一关键信息添加到新模型中,就可以对即将到来的流感季节的整体严重性作出初步估计,因为在今年春季和夏季,流感病毒的变异将在今年开始出现。

“每隔两到三年,病毒就会有一个巨大的基因变化,这可能会使更多的人生病,”杜说。“如果不把进化分解成模型,你就无法在数量上捕捉到这些峰值。”

该模型是建立在H3N2病毒的历史数据基础上的,尽管它可以用于其他流感病毒株。研究人员通过观察2002年至2016年的过去几个季节的预测来测试其准确性,其中包括那些过去不习惯对该工具进行校准的年份(2011-2016年的最后5年)。该报告对美国每年的病例总数做出了准确的估计,并在去年秋天开始之前对2016-17赛季做出了准确的预测。

那么,这个流感季节又有什么用呢?

Pascual说:“这是一个百万美元的问题。”“我们今年的分析显示,病毒已经在显著地改变了。我们预测,疫情的爆发高于平均水平,但并不严重,因为去年是一个糟糕的季节。”

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