第一个对来自冠心病患者的血液、血管和代谢组织进行RNA序列数据系统性分析的研究发表在近期的Science上。文章鉴定了在特定组织中调控心血管疾病遗传风险的基因的相互作用和复杂性,揭示了腹部脂肪是血脂调节的关键部位。
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西奈山伊坎医学院的科学家与来自爱沙尼亚Tartu大学医院、瑞士的Karolinska研究所的SciLifeLab和阿斯利康的研究人员合作在近期的Science上发表了一篇文章,鉴定了在特定组织中调控心血管疾病遗传风险的基因的相互作用和复杂性。
研究的资深作者,西奈山伊坎医学院的教授Johan Björkegren说:“通过对冠心病患者的数百多例组织基因表达数据的分析,我们能够确定疾病的致病基因。它们既有在单一组织中特异的代表也有跨越多个组织网络协作引起心血管病的基因。”
STARNET是首次对冠心病患者组织进行的RNA分析
这个突破性的研究是STARNET研究的一部分。STARNET是第一个对来自冠心病患者的血液、血管和代谢组织进行RNA序列数据系统性分析的研究。
Björkegren教授说:“基因组关联研究(GWAS)已经鉴定了成千上万会增加比如冠心病这样的常见疾病风险的DNA变异。然而GWAS只是了解冠心病的第一步。为了将这些风险标记转化成为新的诊断和治疗的机会。我们必须进入到下一个阶段,发现和鉴定驱动疾病发展的这些DNA变异的基因。此外我们需要了解这些疾病基因在哪些组织、途径和分子网络中是活跃的。所以我们运用STARNET来了解疾病驱动基因和它们的组织属性,这也是开发个性化医疗和精准医学的先决条件。”
STARNET是在2007年由Björkegren教授和Tartu大学医院的首席心脏外科医生ArnoRuusalepp共同推出的。该项目在心脏搭桥手术中收集了600多例临床特征明确的冠心病患者的关键组织。运用复杂的数据分析技术,研究人员发现基因表达的数据在鉴定疾病原因的基因上能够提供充分的信息,它们不仅在冠心病的分子网络中起作用,在其它心血管代谢疾病甚至阿尔兹海默症中也是活跃的。
腹部脂肪是血脂调节的关键
“一个意想不到的重要结果是:除了肝脏,腹部脂肪成为血脂调节的关键部位。”文章的第一作者Oscar Franzén博士说,“例如一个叫做PCSK9基因,可控制低密度脂蛋白(LDL)水平的所谓坏胆固醇,被发现是在腹部脂肪中起作用,而不是在LDL调节的主要部位——肝脏。”PCSK9作为现在进入市场的降脂药的最新靶标,获得了相当的关注。
文章的另一位资深作者Eric Schadt教授说:“STARNET这样的基础研究项目有助于冠心病和其它复杂疾病的成因的研究。我们不仅能够根据之前GWAS分析鉴定的DNA标记确定大量的单个基因,而且我们还发现很多这些下游的基因出现在疾病原因基因的调控网络中。这些调控网络在不少组织和疾病中是共享的。”
在与阿斯利康和SciLifeLab团队的合作中,Björkegren教授的研究团队也用STARNET提高新药靶的开发。阿斯利康科研人员认为Björkegren教授团队的数据集为鉴定新药靶提供了基础的信息,在阿斯利康的治疗领域——心血管和代谢疾病的范畴可以提供存在的靶标。
Ruusalepp大夫说:“意外发现PCSK9跨组织甚至跨多个致病基因疾病活性的现象显示我们对冠心病的起因还了解甚少。作为一个积极治疗冠心病的心脏外科医生,我面临着冠心病巨大的全球负担,它每天都在我们的社会呈现。STARNET已经为了解冠心病的新时代打开了一扇门,为未来的治疗带来激动人心的新希望。”
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