日前,芝加哥大学的科学家们在Nature上发表最新的研究成果。这项研究揭示了N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调控RNA-蛋白质相互作用的一个未知机制。
RNA结合蛋白通过与单链RNA结合基序(RNA binding motif,RBMs)1、2、3的结合来控制细胞的生物学进程。而RBMs会被埋在RNA结构4、5、6、7内部,从而抑制了RNA-蛋白质的相互作用。m6A是一种真核mRNA8-19的最为常见的内部修饰。它涉及包括生物节律、减数分裂和干细胞发育在内的各种细胞功能的控制。
m6A能够选择性地被 YTH域家族蛋白2(human YTH domain family 2,YTHDF2)识别从而影响细胞质mRNA15的稳定性。但是m6A是如何完成这些繁重的生理学作用还需要进一步探索。
本研究表明人类细胞m6A调控RNA结构依赖的RBMs进而影响RNA与蛋白的互作。研究者将这种机制命名为"m6A开关"。
他们还发现m6A就近改变mRNA和长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的结构来促进异构核糖核蛋白C(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C,HNRNPC)与其结合,HNRNPC是一中丰富的核RNA结合蛋白,负责pre-mRNA20-24的加工。研究人员结合紫外交联合并免疫沉淀技术(photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation,PAR-CLIP)以及抗m6A免疫沉淀技术(anti-m6A immunoprecipitation,MeRIP),使得我们能够识别HNRNPC结合区域的多达39060个m6A 开关。球状的m6A的减少会降低HNRNPC与2798个高效m6A开关的结合。并且发现受m6A调控的HNRNPC结合活性会进一步影响目标mRNAs的含量及其选择性地剪切,这表明m6A开关在基因表达和RNA成熟的调控作用。
研究结果说明RNA结合蛋白通过m6A开关来调节其与RBMs的结合,这也为研究RNA修饰编码细胞生物学提供了新的方向。
表观遗传学的研究方兴未艾,Nature Video在相关的视频中把表观遗传学比作细胞的乐章来加以阐述。就是这些细胞的乐章最终构筑了生命的交响。表观遗传学的研究也像这样,本研究的成果也只是交响乐的一个独特的乐章而已,随着研究的深入,相信会有越来越多精彩的工作。
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